Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTKNQ9BST9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTKNQ9BST9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTKNQ9BST9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms