Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPKQ9BS16 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPKQ9BS16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms