Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC39A3Q9BRY0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms