Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KCNS3Q9BQ31 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms