Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms