Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBM4BQ9BQ04 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms