Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMS19Q96T76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMS19Q96T76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMS19Q96T76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms