Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM209Q96SK2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM209Q96SK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM209Q96SK2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms