Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMC6Q96SB8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC6Q96SB8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms