Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9BQ96SB3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9BQ96SB3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms