Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRAMP1Q96RY5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRAMP1Q96RY5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRAMP1Q96RY5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms