Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UIMC1Q96RL1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UIMC1Q96RL1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UIMC1Q96RL1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms