Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMG1Q96Q15 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMG1Q96Q15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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