Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPALINQ96PE5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPALINQ96PE5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms