Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGAP3Q96P47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AGAP3Q96P47 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP3Q96P47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms