Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCLT1Q96NL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCLT1Q96NL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms