Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZSWIM3Q96MP5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM3Q96MP5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM3Q96MP5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms