Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHL15Q96M94 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL15Q96M94 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms