Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00479Q96M42 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00479Q96M42 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms