Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNOT6LQ96LI5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT6LQ96LI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT6LQ96LI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms