Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPZA3Q96KX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPZA3Q96KX2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms