Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNIP3Q96KP6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms