Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PRAC1Q96KF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms