Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRIQ1Q96JM4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
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