Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EAF1Q96JC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EAF1Q96JC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms