Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSL1Q96IY1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSL1Q96IY1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms