Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRELD1Q96HD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRELD1Q96HD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRELD1Q96HD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRELD1Q96HD1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRELD1Q96HD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRELD1Q96HD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CRELD1Q96HD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRELD1Q96HD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms