Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM5Q96HC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDLIM5Q96HC4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms