Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALML4Q96GE6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CALML4Q96GE6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CALML4Q96GE6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms