Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IMP4Q96G21 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IMP4Q96G21 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IMP4Q96G21 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms