Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17Q96FV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17Q96FV3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms