Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms