Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00526Q96FQ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms