Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC10A4Q96EP9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC10A4Q96EP9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC10A4Q96EP9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms