Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CMTM5Q96DZ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms