Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPRY1Q96DX4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPRY1Q96DX4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPRY1Q96DX4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPRY1Q96DX4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPRY1Q96DX4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPRY1Q96DX4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPRY1Q96DX4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPRY1Q96DX4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms