Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GCC1Q96CN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GCC1Q96CN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms