Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDCCAG3Q96C92 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDCCAG3Q96C92 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDCCAG3Q96C92 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms