Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX58Q96C10 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX58Q96C10 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms