Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C3orf49Q96BT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C3orf49Q96BT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms