Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN23Q96B33 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms