Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNKSR1Q969H4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNKSR1Q969H4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms