Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP7Q93009 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP7Q93009 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP7Q93009 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP7Q93009 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP7Q93009 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP7Q93009 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP7Q93009 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP7Q93009 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP7Q93009 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP7Q93009 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP7Q93009 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP7Q93009 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP7Q93009 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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