Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01599Q8WXQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01599Q8WXQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01599Q8WXQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01599Q8WXQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC01599Q8WXQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01599Q8WXQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC01599Q8WXQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC01599Q8WXQ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms