Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSPC1Q8WXF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSPC1Q8WXF1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSPC1Q8WXF1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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