Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJA4Q8WW22 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJA4Q8WW22 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJA4Q8WW22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJA4Q8WW22 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJA4Q8WW22 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJA4Q8WW22 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DNAJA4Q8WW22 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DNAJA4Q8WW22 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms