Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBLCP1Q8WVY7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms