Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX33Q8WV41 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX33Q8WV41 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms