Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC12Q8WUD4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms