Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSC4DQ8WTU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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